巴拿马运河（英语：Panama Canal；西班牙语：Canal de Panama）位于中美洲的巴拿马，横穿巴拿马地峡，连接太平洋和大西洋，是重要的航运要道，被誉为世界七大工程奇迹之一的“世界桥梁”。巴拿马运河由巴拿马共和国拥有和管理，属于水闸式运河。其长度，从一侧的海岸线到另一侧海岸线约为65千米（40英里），而由大西洋（更确切地讲是加勒比海）的深水处至太平洋的深水处约82千米（50英里），宽的地方达304米，最窄的地方也有152米。
巴拿马运河是世界上最具有战略意义的两条人工水道之一，另一条为苏伊士运河。行驶于美国东西海岸之间的船只，原先不得不绕道南美洲的合恩角（Cape Horn），使用巴拿马运河后可缩短航程约15,000公里（8,000海里）。由北美洲的一侧海岸至另一侧的南美洲港口也可节省航程多达6,500公里（3,500海里）。航行于欧洲与东亚或澳大利亚之间的船只经由该运河也可减少航程3,700公里（2,000海里）。 巴拿马运河全长81.3千米，水深13米～15米不等，河宽152米至304米。整个运河的水位高出两大洋26米，设有6座船闸。船舶通过运河一般需要9个小时，可以通航76000吨级的轮船。
巴拿马运河由美国建成， 巴拿马运河自1914年通航至1979年间一直由美国独自掌控。不过，在1979年运河的控制权转交给巴拿马运河委员会（由美国和巴拿马共和国共同组成的一个联合机构），并于1999年12月31日正式将全部控制权交给巴拿马。运河的经营管理交由巴拿马运河管理局负责，而管理局只向巴拿马政府负责。
巴拿马运河的开凿过程是一段不平凡的历史。多少年来，帝国主义一直试图控制拉美国家，包括这些国家的主权领土、能源、交通等等一系列经济来源。处在这一地区的巴拿马共和国曾经就是一个受到扩张、侵占的国家，巴拿马人民在历史上总是陷入复杂的国际角逐，巴拿马运河就是最好的见证。
.jpg)
巴拿马运河位于北纬9°，北美大陆分水岭在该处剧降至其最低点之一。运河并不是如一般人所想像的由东向西横过地峡。而是在大西洋一侧科隆(Colon)的入口向南通过加通水闸(Gatun Locks)进到加通湖的最宽处；然后急转向东，沿一条大致向东南的航道到达太平洋一侧的巴拿马湾。其位于巴尔博亚(Balboa)附近之终点在科隆附近之起点的东南，相距约40千米(25哩)。与运河平行的交通设施有巴拿马运河铁路和博伊德-罗斯福公路(Boyd-Roosevelt Highway)。
船只从大西洋通过运河到太平洋时，先经由利蒙湾(Limon Bay)内长约11公里的进口航道到达加通水闸。在加通有连续3座水闸将船只升高26米(78英尺)，进入加通湖。加通湖系由查格雷斯河(Chagres River)上的加通水坝拦蓄而成，湖水源自阿拉胡埃拉湖(Alajuela Lake, 又名马登湖〔Lake Madden〕；由马登水坝拦蓄而成)，面积425平方公里(164平方哩)，水深14～26米(46～85英尺)不等，至甘博阿(Gamboa)长约37公里(23哩)。切穿大陆分水岭的盖拉德人工渠(Gaillard Cut, 又名库莱布拉水道〔Culebra Cut〕)就是从甘博阿开始的。这条人工渠平均水深约13米(43英尺)，延伸约13公里(8哩)至佩德罗米格尔水闸(Pedro Miguel Locks)。佩德罗米格尔水闸将船只降低9米(30哩)，进入高于海平面16米(52英尺)的米拉弗洛雷斯湖(Miraflores Lake)。船只通过一条长约2公里(1哩)的水道，在米拉弗洛雷斯由两级水闸降低至海平面。运河的最后一段是挖掘而成的进口航道，长约11公里(7哩)，船只经此进入太平洋。运河全程的底宽至少150米(500英尺)；在加通湖，航道的宽度不等，介于150米(500英尺)至300米(1,000英尺)之间，而在米拉弗洛雷斯湖段航道宽度为225米(740英尺)。
巴拿马运河运河的水闸靠加通湖、阿拉胡埃拉湖和米拉弗洛雷斯湖等各湖的重力水流运作，这些湖的湖水是由查格雷斯河及其他几条河流入的。各水闸的长度、宽度和深度均一致。每组水闸都是成对的，船只可以双向同时通过。每一座闸门有两扇，宽20米(65英尺)，厚2米(6.5英尺)，固定在铰链上。门的高度为14～25米(46～ 82英尺)不等；门扇由安装在闸墙凹处的电动机驱动。门扇的开合则由坐落在成对船闸闸墙上的控制塔操控，闸室的充水和放水也由控制塔操控。闸室长300米(1,000英尺)，宽33米(110英尺)，深12米(40英尺)。
稍大的船只须靠运行于闸壁顶部齿轨上的电动机车牵引通过水闸。船只在进入水闸之前，必须经过一道在入口两壁间拉直的防护链。如果一切进行得恰当无误，防护链就会落入水道底部的凹槽内。万一船只行驶太快，为安全起见，防护链就会张紧，于是船只就会撞上防护链。此时，由闸壁上的液压装置控制的防护链会自动松开，慢慢放出，直到把船只拦截停住。如果船只脱出了牵引机车的牵引，冲破防护链，越过第一道门，15米(50英尺)外的第二道门就会保护水闸，阻止船只进一步向前。
防波堤
在两边海洋的运河入口航道附近都筑有很长的防波堤。利蒙湾的东、西两面都有防波堤；西面的防波堤保护港口不受大风(gale)侵袭，而东面的防波堤则是为了减少运河航道的淤积。在太平洋这边，自巴尔博亚到3座小岛(瑙斯〔Naos〕、佩里科〔Perico〕和弗拉明哥〔Flamenco〕)筑有堤道，使得从巴拿马城浅水港口流入运河航道的带有软物质的横流改变方向。
通航
通过运河的每艘船只都有一名或几名领航员领航，他们一直待在船上直到船只离开运河终点。连同等候的时间船只可能需要花15～20个小时才能顺利通过运河。船只一旦获准通行时，其从深水到深水的平均通过时间约为9个小时。盖拉德人工渠在不进行疏浚的时候，一般可双向通行。虽然在每次船只通过时都免不了会流失大量的水，但巴拿马的丰富降水量可维持正常的运作。为节约用水，同一航向的船只，只要其大小容许，就可同时一起通过两艘或多艘船只。
每艘船都有测量员登船查验载重量并收取通行费。船货清单、船照及其他证件均须呈验并登记。沿着航线各点都有自动海洋交通运输控制系统安排并监控船只通过。
允许通过巴拿马运河的船舶的最大尺寸是：
长度：
总长（包括突起部）：950英尺（289.56米）
例外：集装箱船和客船：965英尺（294.13米）
拖船驳船组合，硬性连接：总长900英尺（274.32米）
其他非自推进的船只-拖船的组合：总长850英尺（259.08米）
宽度（船幅）：
船壳板的外表面宽度：106英尺（32.31米）
一般例外：当在热带淡水中吃水小于37英尺（11.3米）时，107英尺（32.61米）。
深度（吃水）：
在热带淡水中：39.5英尺（12.04米）
运河管理局用Gatun湖的淡水作为参考。水的盐度和温度的影响它的密度，从而影响船舶的吃水深度。在异常干燥的季节，Gatun湖的水位低的时候，允许的最大吃水可能会减少。
高限：
从水线到船的最高点：190英尺（57.91米）
该限制也适用于运河南口的巴尔博亚港。例外：在巴尔博亚低水位通过时，205英尺（62.5米）也可通过。
通常所有的例外都必须在特别申请和调查后批准，并且受到限制。
载重：
巴拿马级的货轮通常可以载重65,000-80,000吨，但由于运河的吃水限度，其最大载货量将限制在约52,500吨，其余货物将转运。
有史以来最长的通过巴拿马运河的船舶，是圣胡安勘探者号（the San Juan Prospector，现名Marcona Prospector）矿石散装油船，长973英尺（296.57米），宽106英尺（32.31米）；最宽的是两艘北卡罗莱纳州级战舰“北卡罗莱纳”号（BB-55）“和华盛顿”号（BB-56），宽108英尺（32.92米）。
维护
在热带气候条件下，运河及其有关设施均须不断地进行维护以保持畅通。维护工作包括疏浚航道、水闸定期检修，以及机器的修理和更换。由于降雨量大和土质疏松，盖拉德人工渠两岸山丘的坍塌一直是运河建成以来时常发生的问题。因而必须经常采取防护和补救措施以保持航道畅通，并且定出加固两岸的计划，将雨水引向别处以免破坏山坡。自1970年代以来曾发生过两起严重坍塌，第一次在1974年，第二次在1986年；在两次山崩期，坍塌地段都有一段时期只能单向通航。
另一个威胁运河的严重问题是集水区的各条河川与溪流(乃至运河本身)的淤积和沈淀速度加快。这种恶化情况的发生是由于当地四处迁徙的农民所采行的刀耕火种农业耕作方法所致。1950年代早期运河集水区的林木还很茂密，但是到了1970年代晚期，就减少了近70%。美国和巴拿马政府均曾采取各种控制水土流失的措施。贸易
通过巴拿马运河的交通流量是世界贸易的晴雨表，世界经济繁荣时交通量就会上升，经济不景气时就会下降。1916年通过船只807艘是最低的，1970年交通量上升，通过各类船只高达15,523艘。当年通过运河的货物超过1.346亿公吨(1.325亿长吨)。其后，每年通过的船只数虽有所减少，但由于船舶平均吨位加大，载运的货物比以往还多。
在运河的国际交通中，美国东海岸与东亚之间的贸易居于最主要地位。通过运河的主要商品种类是汽车、石油产品、谷物，以及煤和焦炭。
管理
巴拿马运河管理局负责运河的行政、营运、保护、维修以及巴拿马运河的现代化。巴拿马运河管理局是根据巴拿马宪法修正案成立的巴拿马政府自治机构，1999年12月31日正午从美国巴拿马共同组成的巴拿马运河委员会手中接过运河的管理权。巴拿马运河管理局的一项重要职责是对巴拿马运河集水区的水资源的管理、维持和保护。集水区对运河的运作至关重要，并且还供水给运河航线两端的城市。
巴拿马运河管理局由一个董事会领导。董事会由11名董事组成。董事长具有主管运河事务的部长级地位，由共和国总统遴选任命。董事中，1名由政府的立法部门指派，其余9名由总统征得内阁会议同意后任命。董事的任命须经立法议会绝对多数通过批准。
通行费
在美国管理时期，运河通行费的费率是按维护和营运的成本计算的，因而运河的经费是自筹的。每次通行收取的费用根据船舶装货或载客的容量计算。1914年设定的费率实际上一直没变，持续60年之久。1973年运河的经营第一次亏损，1974年第一次调高几项费率。
传统上，货物都装在甲板之下，通行费是按仓内所载货物计算。然而，由于船舶设计的改变，以及广泛以货柜运送货物，所以一大部分装载货物是在甲板上。通过运河的货柜货物量仅次于谷物和石油产品的装运。这些变化导致计量规则的改变和制定甲板上货柜箱容量通行费的估定办法。在巴拿马运河委员会的领导下，巴拿马运河管理局批准了在计量规章上的类似改变，并在运河移交之后仍然保持美国管理时期的通行费费率。
从收取的通行费中，巴拿马运河管理局必须缴纳给巴拿马国库年度税费。在缴纳年度税费并付出运河的营运与维护开支后，所有的盈余也都全部上缴国库。
1914年8月15日巴拿马运河正式通航，极大地缩短了美国东西海岸间的航程，比绕合恩角缩短了1万4千8百公里。在第二次世界大战期间美国利用运河将航空母舰送去补充几乎被毁灭的太平洋舰队。航空母舰虽然能够通过运河，但有需要先拆除航标，腾出航道。
2004年财政年度期间总共有14,035艘船只，总吃水266,916,576吨通过巴拿马运河。
运河的主权于1999年交还巴拿马，由于运河无法通过巨型油轮和如今的大型航空母舰，美国正在计划在中美洲其他地方开凿新的运河。
通过运河的全程需花费10小时。平均每艘船只通行费约为13,430美元。
作为世界上最具战略意义的人工水道，巴拿马运河与苏伊士运河齐名，被称为“世界七大工程奇迹之一”。它的战略意义对美国尤其突出。运河开通前，行驶于美国东西海岸之间的船只，原先不得不绕道南美洲的合恩角，使用巴拿马运河后可缩短航程约1.5万公里。在第二次世界大战期间，美国利用运河将航空母舰送去补充几乎被毁灭的太平洋舰队。
“巴拿马运河是人类历史上几大非凡的时刻之一，是美国工程和技术力量的伟大样本，它见证了美国霸权时代的到来。”美国马里兰大学教授格林如此评价运河对美国的意义。
美国“国会山”网站称，100年后，美国仍然是巴拿马运河的最大受益者。从美国的角度来看，当年西奥多·罗斯福的3.75亿美元(相当于今天的80亿美元)的投资对于美国农民、工人、制造商和消费者带来的利益是巨大的。去年经由巴拿马运河的3.3亿吨货物中，有2/3是来自或者运往美国。
过去百年，从运河的使用情况可以看出国家的兴衰。法国《观点报》说，每年有多达1.4万艘船缓慢通过巴拿马运河，耗时10小时，经由这条运河的航线连接着全球160多个国家的1700多个港口，巴拿马运河的通航彻底改变了全球贸易，并便利美国将自己的舰队和商船队迅捷地从东海岸调到西海岸。上世纪50至60年代，日本的崛起让该运河连接欧亚的功能凸显，而近几十年来，它又成为拉美和中国间贸易的枢纽。根据巴拿马运河官方网站的统计数据，2013年中国在运河的主要使用国中位居第二，按通过货物的吨位来算，美国以1.38亿吨高居第一，中国以4600万吨居第二。第三是智利，为2900万吨。
背景
在遥远的殖民时代，巴拿马地峡是连接太平洋与西班牙宗主国的交通枢纽，每年一度的波托弗洛交易会吸引着欧洲各大商行的代理商，在这里，成吨的秘鲁白银与欧洲货物进行着有利可图的交易，巴拿马因商业和海运日益繁荣。然而，这并没有改变它从属的地位。
早在15世纪，征服墨西哥的西班牙人瓦斯科·科尔特斯就提出过修建运河的主张，但他未指明适合开凿的地点，后来，在瓦斯科·努涅里·巴尔沃亚征服巴拿马之后，1523年，西班牙国王查理一世（即神圣罗马帝国的查理五世）明确提出了开凿一条中美洲运河的主张。
1534年，西班牙国王卡洛斯一世下令对巴拿马地峡进行勘查，西班牙人沿着山脊用鹅卵石铺出了一条穿越地峡的驿道，算是为开凿作了准备。从18世纪开始，西班牙殖民政府陆续派员勘查了四个备选地点 ：墨西哥南部的特万特佩克地峡； 哥伦比亚西北部的阿特拉托河附近的某个地点； 尼加拉瓜地峡；巴拿马地峡。，1771年，勘查了特万特佩克地峡然而到1814年，当西班牙终于决定开凿运河时，拉美独立战争的爆发却打乱了整个计划。1823年，由危地马拉、萨尔瓦多、洪都拉斯、尼加拉瓜和哥斯达黎加五国组成的中美洲联邦共和国成立，它正式向美国提出了援建运河的请求，次年6月，拉美自由之父西蒙·玻利瓦尔在巴拿马召开的国际会议上，中美洲运河的开凿正式提上了日程。 在拟议的四个开凿地点中，巴拿马地峡以最窄（61公里）、尼加拉瓜地峡以有尼加拉瓜湖和圣胡安河可资利用，逐渐成为众望所归。 在经济上，开凿运河的好处不言而喻，随着大西洋和太平洋之间的航运日益发达，一条更为便捷的航路显然会带来很多好处，如果运河开通，纽约至旧金山的航程可以缩短16%，利物浦至旧金山的航程缩短43%，而纽约至悉尼的航程也缩短28%，意义非凡。 下令开凿巴拿马运河的是美国第二十六任总统西奥多·罗斯福，这是他任内的主要功绩，他也因此被美国人民雕入总统山。
开凿权
在19世纪，巴拿马地峡处于哥伦比亚共和国的管辖之下，1831年－1858年，哥伦比亚改称为新格拉纳达，这个年轻的小国显然希望未来的运河能在它的版图之内，但其有限的财力又无法支撑如此浩大的工程，于是，借重外部力量成为合理的选择。然而，拉美民族天生的敏感，使得新格拉纳达政府小心地规定开凿运河的租让权只能交给民间公司，而不允许外国政府介入。
1838年，一家法国公司曾派人对巴拿马地峡进行了勘测，卒因得不到政府的支持而作罢。1843年，新格拉纳达政府照会英、法、美、荷、西班牙等国，提议由它们合建巴拿马运河，并由各国共同保证运河未来的中立地位，但除美国以外，各国均未予理睬。
早在1835年，美国即与新格拉纳达就开凿运河一事进行过磋商，当时无果而终，这次新格拉纳达旧事重提，美国自然乐于接受。1846年12月12日，经过历时一年的谈判，美国与新格拉纳达缔结了《美国、新格拉纳达和平、友好、航海及通商条约》，也称《彼得拉克－马利亚里诺条约》，条约共36条，有效期为20年，其中第35条规定美国获得以下权利：
美国公民、船只、商品在其境内可以享有新格拉纳达公民所能享有的种种权利（全部免税、特权和豁免），通过巴拿马地峡的美国旅客、邮件和商品也应给予同等优惠，将来在巴拿马修建任何交通设施时，其通行权或过境权应对美国政府和公民自由开放，新格拉纳达政府不得向美国公民征收高于新格拉纳达公民的通行费用，对美国商品也不得征收进口税。
在此基础上，美国政府也对新格拉纳达作出三项承诺：
1、保证巴拿马地峡地带的完全中立；
2、保证未来运河的自由通行在任何时候都不会被中断或受到阻碍；
3、保证新格拉纳达政府拥有巴拿马地峡的主权和财产权。考虑到新格拉纳达政局动荡，为防意外，美国人也还留了几手。1848年美墨战争结束后，美国与墨西哥签订《瓜达卢佩－伊达尔哥条约》，掌握了在特万特佩克地峡开凿运河的权力，1849年，又与尼加拉瓜签订《斯夸尔条约》，取得了开凿尼加拉瓜运河的特权。
1849年，加利福尼亚发现金矿，经济飞速发展，运河的开凿日益受到各方关注，羽翼未丰的美国预见到实力雄厚的英国可能会参与开凿运河的争夺，于是未雨绸缪，抢先向英国提出未来巴拿马运河中立化的建议，得到英国热烈响应。1850年4月19日，美国国务卿约翰·克莱顿与英国全权代表亨利·布尔沃在华盛顿签订了《美国和英国关于连接大西洋和太平洋的通航运河的条约》，规定：美国和英国均不得对前述通航运河为自己取得或维持任何排他性的控制，同意任何一方均不得在该运河的要冲地区或附近建立或维持任何要塞，也不得对中美洲的任何部分实施占领和统治。条约承诺，当缔约双方发生战争时，任何一方也不能向对方封锁运河，美、英两国共同负责保护任何一方修建运河工程的财产不受侵犯，运河完工时，双方将保护它，使其不受阻碍、劫夺或不公允的没收，双方共同保证运河的中立，以使该运河永久自由开放，所投入的资本稳固可靠。通过这一条约，美国排除了英国以武力独占运河的危险。
然而，《克莱顿－布尔沃条约》是一个充满妥协和折衷的外交文件，存在许多漏洞，它虽然使未来的巴拿马运河中立化，但文字含糊不清、模棱两可，执行中存在极大的争议。1850年，美国耗资750万美元在巴拿马地峡修建连接两大洋的铁路，历时五年完工，1849年，一家美国公司准备开凿以格雷敦为终点的横贯尼加拉瓜的运河时，英国人援引《克莱顿－布尔沃条约》，指责美国侵犯了受英国保护的印第安人莫斯基托王国的合法权益，致使工程下马，这个挫折让美国人认识到也许在巴拿马地峡开凿运河是一个更为合算的选择。
按照美国与新格拉纳达签订的条约，从1846年起，美国公民获得穿过巴拿马地峡的权力，潮水般涌来的美国游客带来了美元，但在对北方强邻怀有恐惧的巴拿马人看来，这种经济上的输血却几近侵略，1856年发生的一起看似偶然的流血事件就是证明。
当年4月15日，一名美国人在巴拿马火车站购买西瓜时与摊主发生纠纷，拒付货款，双方遂起争端，由于围观的巴拿马人和美国人情绪激动，冲突很快演变成一场持续数小时的枪战。作客的美国人自然难讨便宜，死伤31人，巴拿马方面伤亡15人。事件发生后，美国的特派全权专使警告新格拉纳达政府：如果拒绝迅速赔偿损失，美国将立即占领巴拿马地峡。对此，新格拉纳达总统的回答很简单，但却形象地反映了弱小民族的微妙心态：
硬要使任何一个地峡的过客有权向我们的公民开枪，而我们的公民必须逆来顺受，这是极不公平的，也是横行霸道的，容忍这种屈辱的民族是不配生存的！
然而，爱国的冲动和激情的表白无法掩饰国家的虚弱。7月，2艘美国巡洋舰“独立”号和“圣玛丽”“号驶抵巴拿马，1856年9月19日，160名美国海军陆战队员登陆，占领了巴拿马火车站，这才让激动的新格林纳达政府平静下来。1857年2月，两国开始谈判，美国代表提出巴拿马城与科隆城应成为自治的自由港，两国共管以巴拿马铁路为中心的宽约40公里的地峡，巴拿马湾的某些岛屿要割让给美国，赔偿美国公民在事件中的一切损失。美国代表也表示，如果新格拉纳达政府接受这些条件，美国愿支付200万美元作为补偿。然而，新格林纳达政府显得毫无诚意，除赔偿外，它拒绝接受其它条件，谈判一直拖延到1865年美国南北战争结束后，才正式达成条约，1861年已改名为哥伦比亚的新格拉纳达承诺赔偿美国41万美元。
1867年1月23日，因1848年的条约行将期满，哥伦比亚照会美国，要求重新谈判。12月，哥伦比亚将新约草案交给美国审议，该条约规定：哥伦比亚同意美国承建巴拿马运河，提供修建运河的地区，对未来运河的中立，由两国实行共同防御，但此时的美国忙于南北战争的重建和1868年的总统选举，因此迟至1869年1月14日，条约才正式签署。
按照这份新约，哥伦比亚将巴拿马运河开凿权及运河地区租让给美国，租期100年，期满后归还哥伦比亚，美国政府不得将租让权转让给它国，仅可转让给私营公司。浮躁的哥伦比亚舆论认为条约迁就了美国的利益，群情激奋，3月，哥伦比亚国会否决了这个条约。
1870年1月，两国签订了一个补充条款，规定美国军舰可以随时通过运河而对美国的交战国则实行关闭政策，哥伦比亚舆论又认为这一条款事实上使哥伦比亚成了美国的军事盟友，要求修改，结果被美方拒绝。美国的强硬态度令哥伦比亚政府感到失望，哥伦比亚舆论则认为，山姆大叔根本不急于修建运河，而只是对独霸运河区感兴趣。
为了“惩罚”美国，哥政府改弦更张，转而把目光投向欧洲大陆，开始积极与欧洲国家商讨开凿运河的可行性，恰逢1869年，由法国主导的苏伊士运河通航，欧洲金融资本顺理成章地将目光转移到中美洲。1876年，由法国控制的洋际运河工程国际公民协会在巴黎成立，着手对巴拿马运河的开凿进行相关论证，此举得到了哥伦比亚政府的认可。
不久，协会派出以法国军官吕西安·怀斯中尉为首的调查团赴巴拿马进行实地考察，怀斯的活动能力很强，1878年3月20日，他居然以协会的名义成功地与哥伦比亚政府达成了由法国来承建巴拿马运河的协议。规定：协会必须在五年内组成运河工程公司并完成运河工程的勘测，从第五年开始的12年内应当建成巴拿马运河；运河通航后，哥伦比亚政府每年可从运河公司的收益中按比例提成，头25年为每年5%，此后三个25年分别为6%、7%、8%，但最低数字每年不得少于25万美元，租让期为99年，期满后运河即归哥伦比亚政府所有，期满以前，租让权可转给其它公司，但不得转让给其它大国政府。
1879年5月，协会邀请因规划组织开凿苏伊士运河而声名鹊起的法国著名外交官费尔南德·德·雷赛布为主席，召开了审议巴拿马运河问题的国际会议，英、美、德等国的代表也分别与会，会议不顾美国代表的强烈反对，通过了开凿巴拿马运河的决定。7月5日，法国洋际运河工程总公司正式成立，得到开凿运河的租让权，开始积极筹备运河工程。
开凿
在雷赛布的领导下，法国洋际运河公司经过数年的准备，制定了8套施工方案，最后定于1883年2月，正式动工开凿巴拿马运河，整个工程由雷赛布本人亲自主持，这使欧洲的投资者深怀信心。雷赛布是职业外交家，1825年以来，历任驻里斯本副领事助理、亚历山大领事、开罗领事、巴塞罗那总领事，最后升至驻马德里公使，因为曾在埃及、突尼斯长期工作，雷赛布在阿拉伯世界中享有相当高的威信。1854年，埃及总督赛义德帕夏授权雷赛布开凿苏伊士运河，雷赛布详细研究了拿破仑远征埃及期间，法国工程师勒佩尔对苏伊士地峡的考察报告，定下了在地中海和红海之间开辟直接通道的施工方案。由于准备充分、资金到位，运河的工程进展顺利，1859年4月25日动工，到1869年11月17日苏伊士运河就正式通航了。苏伊士运河的成功修建，使雷赛布的声誉达到顶峰，他成为法兰西学院院士、法国科学院院士、得到荣誉军团大十字勋章和印度星形勋章，英国皇室授予他伦敦荣誉市民称号。往昔的成功令雷赛布十分陶醉，他机械地照搬修建苏伊士运河的成功经验，而对巴拿马的特殊地形估计不足，在没有详细调研的基础上草率地制定了施工方案，结果酿成了一场灾难。
巴拿马地峡是热带雨林气候，潮湿闷热、丛林密布、交通闭塞、地形复杂，基础设施落后，缺乏起码的施工条件，当来自55个国家的4万施工大军进驻之后，人们才发现那里简直是一个人间地狱：参天的密林中毒虫遍布，令人难以容忍，炎热的天气使可怕的疫病蔓延开来，夺走了大批工人和技术人员的生命，在加通水闸附近的希望之山上，林立的墓碑令人不寒而栗。
比炎热气候和恶劣环境更可怕的是人为的失误，起初，雷赛布照搬苏伊士运河的经验，认为可以利用巴拿马地峡众多的湖泊修建一条海平式运河，谁知施工四年之后，傲慢的法国人才发现巴拿马地峡临太平洋一端的海面，要比加勒比海一端低出20多厘米，根本无法修建海平式运河，这个过迟的发现给法国洋际运河公司以致命的打击。
最令雷赛布烦心的还有美国人的拆台，运河的设计走向与美国人经营的巴拿马铁路平行，这主要是为了便于运输物资，但美国人根本不予配合。铁路部门对运河物资的配送百般设障，消极对待，最后逼得法国运河公司不得不以2550万美元的天价买下这条仅值750万美元的铁路，但留用的美国员工继续捣乱，破坏怠工，致使铁路根本无法正常运营。
最后，法国运河公司在经营管理上也出现了问题，以雷赛布为首的高管层在工程难以为继的情况下，却大肆侵吞公开发行的运河股票资金；为掩盖真相，继续增发债券，公司动用大笔金钱贿赂官员，法国政府先后有150名部长和议员接受了贿赂，然而纸包不住火，到1889年，法国洋际运河公司山穷水尽，不得不宣告破产，雷赛布本人也上了法庭。
1894年9月，为了收拾这个烂摊子，法国政府牵头另组了一家公司，接手运河工程，决定将原来的海平式运河改成水闸提升式运河，但是由于雷赛布的工程仅完成了三分之一，预算超过原计划一倍以上，剩下的三分之二又是最艰难的地段，而距离原定的竣工日期只有6年了。眼看无法按期交工，1898年11月，法方不得不请求哥伦比亚政府将工期宽限至1910年10月，为此法国愿意支付2000万法郎作为补偿。2月，哥伦比亚政府派代表尼科拉斯·埃斯格拉来到巴黎，他充分体谅法方的困难，提出只要补偿500万法郎即可，这样，法国人就以比较有利的条件得到了延期4年竣工的权力，虽然如此，完成巴拿马运河仍然是杳然无期。
埃尔兰条约
本来，美国政府就对法国如此轻易地得到巴拿马运河的租让权，感到不满，时任美国总统的拉瑟福德·伯查德·海斯指出：美国必须把巴拿马运河控制在自己手中，它决不能放弃这种控制而将运河交给任何一个欧洲国家！
在美国，以阿尔弗雷德·马汉和西奥多·罗斯福为代表的海权论者，非常重视巴拿马运河的战略地位，1898年美西战争期间，美国新式战列舰“俄勒冈”号为了从西雅图赶往古巴参战，居然要绕道合恩角，这一事实极大地刺激了美国政府和舆论。
为了向哥伦比亚和欧洲国家施压，与法国运河公司抗衡，美国也组织了一个巴拿马运河工程临时协会，由南北战争的著名将军、前总统尤利塞斯·格兰特为主席，1880年，美国2艘巡洋舰驶抵哥伦比亚港口“访问”，炫耀武力，1881年2月，美国与哥伦比亚签署了一项协定：两国应在巴拿马地峡的战略要点建立海上军事防卫据点，这些据点平时由哥伦比亚人守卫，战时则由美国海军陆战队负责，不过，这项协议很快又被哥伦比亚国会否决。
为了纾解美国的压力，哥伦比亚呼吁欧洲国家共同保证巴拿马运河的中立地位，但这一要求遭到美国政府的坚决抵制，这时的美国逐渐意识到原来的“克莱顿－布尔沃条约”是一个束缚，于是策划抛开英国，独享巴拿马运河的控制权。在1898年的美西战争之后，美国在政治、军事和经济上都成为世界强国，而英国却深陷于布尔战争的泥潭，在这种背景下，英国政府决定放弃原来对巴拿马运河的分权要求，以换取美国的外交支持。
1898年12月到1900年2月5日，英、美两国历经旷日持久的谈判，终于签署了《美国和英国关于促进建造通航运河的条约》，也称《海约翰－庞斯福特条约》，以取代原来的“克莱顿－布尔沃条约”。新约确立了美国主持开凿巴拿马运河并享有制定运河管理规定的特权，英国只保有运河通航的自由权，12月20日，美国又抛出三个修正案，进一步强化了对运河的控制，英国亦无条件接受，至此，美国完全排除了英国的干扰，可以专心对付法国了。
法国人在开凿巴拿马遭遇滑铁卢后，1899年8月，美国派一个以海军专家约翰·沃尔克为首的技术委员会来到巴黎，与法国政府接触，探寻转让运河租让权的可能性，次年4月，又提出收购法国运河公司的要求，但遭到该公司总经理于坦和法国政府的拒绝。此后，美国加紧向法方施压，1899年12月27日，美国新泽西州成立了一家巴拿马运河公司，展开大规模游说活动，为收购法国运河公司制造舆论。此招未能奏效，美国转而采取声东击西的办法，故意放风说要与尼加拉瓜合作，另建运河与巴拿马运河抗衡，这个故意散布的假消息收到了奇效，被吓懵了的哥伦比亚驻美公使马丁内兹·席尔瓦，在未请示本国政府的前提下，就匆忙草拟了一个将法国运河公司的租让权转让给美国的协议，建议由美国代替法国开凿运河，租期为100年，期满后可续租，美国可以在运河区驻军，每年只需支付给哥伦比亚政府60万美元。
席尔瓦的草率方案遭到了哥伦比亚政府的严厉批驳，但它的内容却意外地泄漏了出去，成为美国要胁哥伦比亚的一张王牌，席尔瓦因此很快被撤职。为了给内外交困的法国运河公司施压，1901年12月，美国议会开始讨论拨款建造尼加拉瓜运河的问题，这对巴拿马运河的开凿造成了很大冲击，迫使态度强硬的法国运河公司总经理于坦辞职，新任总经理莫理斯·博无意与美国人叫板。1902年1月4日，在征得公司董事会同意后，莫理斯·博电告美国政府，愿以4000万美元的价格转让其财产和租让权，1月28日，美国国会授权西奥多·罗斯福总统完成对法国运河公司的收购，但转让还须得到哥伦比亚政府的同意才能生效。
这时，哥伦比亚新任驻美公使文森特·孔查接到本国政府指示：只要美国付给法国的4000万美元中有一半属于哥伦比亚，可与美国进行谈判。哥伦比亚政府的方案是：将宽度为6英里的运河区划归美国，租借期为99年，期满后运河由哥伦比亚收回，不得续租，运河治安由哥国军警负责，租金也需相应提高，但这个方案遭到美国的坚决反对。
6月28日，美国通过《斯普纳法案》，规定美国以4000万美元取得法国运河公司的财产，并对运河区的治安作出了符合美国利益的规定，法案强调如果哥伦比亚政府拒绝上述建议，美国就着手开凿尼加拉瓜运河，并立即拨款1000万美元筹备工程。此时，巴拿马已经出现了由美国策动的独立运动，内外交困的哥伦比亚却幻想借助美国的力量平定叛乱，于是训令孔查立即接受美国的要求，并且只索取1000万美元及每年60万美元的租金。消息传出，哥伦比亚舆论哗然，孔查更是拒绝执行，11月15日，哥伦比亚外长保拉再次训令孔查无条件接受美国的建议，孔查以辞职作为抗议，11月28日，他竟作为精神病人被美国驱逐出境。
孔查离职后，哥伦比亚驻美公使馆一秘托马斯·埃尔兰继任谈判代表，此君是亲美分子，为使美国满意，他甚至将运河年租金降至25万美元，1903年1月22日，美国与哥伦比亚签订了《海约翰－埃尔兰条约》，该条约纯粹是席尔瓦草案的粗暴翻版。哥伦比亚媒体一致认为《海约翰－埃尔兰条约》是一个丧权辱国的不平等条约，号召人民起来反对，甚至提出“寸权不能失、寸土不可丢”的口号。美国驻哥伦比亚公使也不得不承认：“哥伦比亚舆论在情绪上是坚决反对批准条约的，他们把这个条约看成是强国企图花几个小钱来剥夺它所享有的世界上最有价值的财富！”1903年3月17日，美国参议院悍然批准了《海约翰－埃尔兰条约》，但8月12日，哥伦比亚国会慑于公众压力，否决了这个条约。
扩建
巴拿马人接管运河后采取了一系列的先进技术和管理办法，运河的运营效率大大提高。但随着全球经济的发展，世界贸易活动以及货运量的大幅增加，越来越多的超大型船只投入运营，巴拿马运河现有通航条件已不能适应发展的需要。巴拿马运河船闸只有304.8米长、33.53米宽、12.55米深，只能允许巴拿马型船在几乎贴着墙壁的情况下通过，超巴拿马型船则必须绕走南美洲的合恩角。
为使巴拿马运河顺应时代的发展，巴拿马政府于2006年4月24日正式提出了总投资为52.2亿美元的运河扩建计划，并于同年10月就运河扩建举行全民公投。公投结果显示，超过78%的投票者支持运河扩建，运河扩建计划获得通过。
根据扩建计划，巴拿马将在运河的两端各修建一个三级提升的船闸和配套设施。新建船闸的宽度为55米，长度为427米，可以让超巴拿马级船只通过。运河扩建资金的大部分将通过收取运河通行费来筹集。运河扩建后，每年将有1.7万艘船只从这里通过，运河的货物年通过量也将从如今的3亿吨增加到6亿吨。
2007年9月3日，巴拿马运河扩建工程正式开工。人民网2010年8月15日电，据来自巴拿马城的消息，连接两大洋的巴拿马运河在扩建中迎来96周年。根据计划，整个扩建工程将于2014年巴拿马运河建成100周年时竣工。
待到巴拿马运河纪念通航100周年之时，长427米、宽55米、深18.3米的第三套船闸将建成，整个巴拿马运河扩建工程也将完工。届时，超巴拿马型船和军舰可轻松通过巴拿马运河，运河货物年通过量也将从如今的3亿吨增加至6亿吨。
巴拿马运河承担着全世界5%的贸易货运。中国是巴拿马运河的第二大用户。
新运河
随着世界经贸交流的扩大、海上运输日益繁忙、造船技术的发展，巴拿马运河已难以满足当今海运要求。每年都有成百上千艘各国船只因吨位大而不能从运河通过。开凿一条连接大西洋、太平洋新运河的设想便应运而生。巴拿马运河承担着全世界5%的贸易货运量，美国与亚洲之间贸易货运量的23%都需要通过这条运河。但由于设计老旧，巴拿马运河在某种程度上已经成为现代海运贸易的发展瓶颈。它至今仍然延用100多年前的设计，仅可以通航7.6万吨级的货轮，已经远远不能满足现代海运贸易的需要。许多不符合“巴拿马运河”标准的货轮不得不去绕行合恩角。正是看到了跨洋海运贸易的巨大潜力，巴拿马的周边国家纷纷开始寻求修建巴拿马运河的替代工程。
1982年，美国、日本和巴拿马三国经过协商，成立了一个“开凿大西洋—太平洋国际海洋运河可行性调查委员会”，着手进行开凿新运河的计划工作。1985年9月10日，三国政府又在巴拿马城正式成立了“开凿运河三边委员会”，致力于联合开凿第二条运河的筹备工作。经过近2年调查，“三边委员会”已从墨西哥到哥伦比亚之间可供选择的几十条新运河线路中筛选出4条，再从中选出最佳一条，即位于现巴拿马运河以西15公里至20公里处，从太平洋一侧的凯米托港到大西洋一侧的拉加尔托港。新运河全长100公里，开挖深度拟为现运河的2.5倍，落潮时水深30米，可通航30万吨级巨轮，涨潮时水深40米。这将是一项举世罕见的宏大工程，仅土方需挖10亿立方米，总耗资额高达200亿美元，整个工程至少需要14年时间。
除日本、美国、巴拿马外，英国、德国(原联邦德国)、澳大利亚、加拿大和法国也报名参加这一工程。其中，日、美两国将负责总工程费用的70%，余下的由其他国家承担。如果一切顺利，到21世纪初，一条新巴拿马运河将横亘于中美洲地峡之间，把太平洋大西洋更加紧密地联系在一起，为人类做出更大贡献。
